88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0157 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  100 
 
 
519 aa  867    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  98.27 
 
 
516 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  96.92 
 
 
533 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  99.8 
 
 
517 aa  848    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  96.69 
 
 
534 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  96.01 
 
 
635 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  92.82 
 
 
535 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  61.65 
 
 
527 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  56.29 
 
 
562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  56.29 
 
 
562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  59.47 
 
 
501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  56.26 
 
 
562 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  56.95 
 
 
561 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  56.68 
 
 
558 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  55.34 
 
 
527 aa  283  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.74 
 
 
484 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  58.63 
 
 
499 aa  257  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  59.76 
 
 
502 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  52.05 
 
 
478 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  50.5 
 
 
369 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  48.57 
 
 
587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  49.29 
 
 
601 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  49.62 
 
 
354 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  55.72 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  45.61 
 
 
584 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  59.04 
 
 
389 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  46.43 
 
 
336 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  46.43 
 
 
336 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  46.43 
 
 
336 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  54.74 
 
 
408 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  46.18 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.63 
 
 
457 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.41 
 
 
491 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.41 
 
 
491 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  47.97 
 
 
356 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  47.97 
 
 
356 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  44.05 
 
 
573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  44.38 
 
 
420 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  43.82 
 
 
421 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  43.82 
 
 
421 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  43.82 
 
 
421 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  43.82 
 
 
421 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  43.82 
 
 
421 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  43.82 
 
 
421 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  43.82 
 
 
421 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  44.61 
 
 
409 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  45.43 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  45.43 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  45.43 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.91 
 
 
374 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.91 
 
 
354 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  41.9 
 
 
450 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  44.02 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.08 
 
 
459 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.84 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  44.57 
 
 
436 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  44.57 
 
 
436 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  40.11 
 
 
423 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  44.19 
 
 
436 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  40.11 
 
 
423 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.63 
 
 
370 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  39.84 
 
 
471 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50.48 
 
 
353 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  41.29 
 
 
409 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  39.86 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  40.86 
 
 
429 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.2 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  38.32 
 
 
393 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  44.25 
 
 
419 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  38.96 
 
 
473 aa  133  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  40.08 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  40.08 
 
 
429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  43.48 
 
 
338 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  39.66 
 
 
274 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.32 
 
 
361 aa  120  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  38.52 
 
 
903 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  32.81 
 
 
472 aa  90.9  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  34.31 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  32.43 
 
 
559 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.15 
 
 
249 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  35.93 
 
 
913 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  36.61 
 
 
991 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.29 
 
 
269 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  71.23 
 
 
364 aa  61.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  36.16 
 
 
828 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  38.75 
 
 
941 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  35.96 
 
 
1860 aa  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  43.22 
 
 
667 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>