80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5644 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  78 
 
 
380 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  80.92 
 
 
389 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  55.35 
 
 
517 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  55.35 
 
 
519 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  55.35 
 
 
516 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  55.66 
 
 
533 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  56.67 
 
 
635 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  55.49 
 
 
534 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  61.66 
 
 
561 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  56.52 
 
 
501 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  55.71 
 
 
535 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  61.75 
 
 
562 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  61.75 
 
 
562 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  60.47 
 
 
562 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  58.1 
 
 
527 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  46.84 
 
 
427 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  59.02 
 
 
558 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.02 
 
 
478 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  50.34 
 
 
356 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  50.34 
 
 
356 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.69 
 
 
484 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  46.98 
 
 
601 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  44.64 
 
 
409 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.15 
 
 
457 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.38 
 
 
491 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.38 
 
 
491 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  46.98 
 
 
587 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  48.73 
 
 
527 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  47.56 
 
 
584 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  47.11 
 
 
573 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  47.13 
 
 
369 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  48.21 
 
 
354 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  48.9 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  48.9 
 
 
354 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  49.07 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  49.07 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  49.07 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.49 
 
 
370 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  48.71 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.6 
 
 
384 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  46.96 
 
 
499 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.12 
 
 
385 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  40.48 
 
 
471 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.86 
 
 
361 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  42.65 
 
 
278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  40.06 
 
 
420 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  39.81 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  41.2 
 
 
423 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.18 
 
 
459 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  40.72 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  40.74 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  40.27 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  39.6 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  40.27 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  39.02 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  39.6 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  39.6 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  39.6 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  40.27 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  39.6 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  39.6 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  39.6 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  48.45 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  37.97 
 
 
473 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  38.57 
 
 
459 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  38.57 
 
 
429 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  39.62 
 
 
274 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  36.07 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  41.79 
 
 
436 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  41.79 
 
 
436 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  41.79 
 
 
436 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  47.62 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  38.02 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  39.74 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  39.81 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  39.36 
 
 
903 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  35.11 
 
 
559 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.04 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.86 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>