72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0653 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  962    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.2 
 
 		 484 aa  90.1  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  35.19 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  35.19 
 
 		 517 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  35.19 
 
 		 519 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  34.11 
 
 		 534 aa  87  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  37.02 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.24 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.24 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.11 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  36.76 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.92 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  34.54 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  35.66 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  35.66 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  35.66 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  34.36 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  36.07 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  39.02 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  39.02 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  36.74 
 
 		 635 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  33.86 
 
 		 384 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  36.67 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  36.78 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  37.5 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  36.78 
 
 		 423 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  35.2 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  33.53 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  35.2 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  36.68 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  36.68 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  36.68 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  48.75 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  48.75 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  33.62 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  31.58 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  33.62 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  33.16 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  47.5 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  34.87 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  48.05 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  34.02 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  33.72 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  33.98 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  34.48 
 
 		 457 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  33.75 
 
 		 380 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.16 
 
 		 249 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  33.75 
 
 		 389 aa  53.9  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 601 aa  53.5  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  45 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  61.43 
 
 		 380 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.24 
 
 		 269 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  30.89 
 
 		 584 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  61.67 
 
 		 445 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  54.84 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  55.29 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  55.29 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  37.44 
 
 		 561 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  30.27 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  35.26 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  58.73 
 
 		 295 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  38.2 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  35.8 
 
 		 436 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  35.8 
 
 		 436 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  35.8 
 
 		 436 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>