62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1654 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  796    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  35.01 
 
 
527 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.44 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  33.33 
 
 
517 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  33.33 
 
 
519 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
516 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  33.63 
 
 
533 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  33.82 
 
 
534 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  33.33 
 
 
635 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  30.7 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  35.42 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  31.88 
 
 
478 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  33.18 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  33.61 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  33.61 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  33.33 
 
 
587 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  34.33 
 
 
584 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  32.29 
 
 
535 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  33.9 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  33.9 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  31.05 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  35.18 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  30.51 
 
 
601 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  33.74 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  34.85 
 
 
559 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  32.95 
 
 
369 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  34.89 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  33.19 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  34.89 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  34.89 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  32.54 
 
 
423 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  31.43 
 
 
278 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  32.14 
 
 
473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  33.8 
 
 
474 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  33.8 
 
 
474 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  33.8 
 
 
474 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  30.43 
 
 
459 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  30.43 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  36.32 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  36.32 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  32.64 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  35.82 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  38.3 
 
 
499 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  34.59 
 
 
429 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  29.74 
 
 
573 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  29.44 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  33.83 
 
 
419 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  32.81 
 
 
459 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  29.52 
 
 
274 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  29.5 
 
 
374 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  30.43 
 
 
501 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  28.82 
 
 
472 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  32.1 
 
 
420 aa  47  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  31.86 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  31.86 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  31.86 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  31.86 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  31.86 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  31.86 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  31.86 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  34.55 
 
 
353 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  35.2 
 
 
502 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>