83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2684 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  99.44 
 
 
587 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  95.39 
 
 
369 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  94.63 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  94.63 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  94.63 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  94.35 
 
 
584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  93.22 
 
 
601 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  56.28 
 
 
573 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  50.63 
 
 
516 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  50.63 
 
 
519 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  50.63 
 
 
517 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  50.38 
 
 
533 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  50.38 
 
 
534 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  49.5 
 
 
635 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  57.14 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  46.62 
 
 
535 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  47.46 
 
 
484 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  52.21 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  52.21 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  51.84 
 
 
436 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  46.99 
 
 
527 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.82 
 
 
478 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  43.49 
 
 
409 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  52.4 
 
 
419 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  45.36 
 
 
527 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  46.49 
 
 
501 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  53.21 
 
 
429 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  44.58 
 
 
562 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  43.96 
 
 
562 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  43.96 
 
 
562 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  56.22 
 
 
903 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  50 
 
 
561 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.92 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  41.06 
 
 
427 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  50.82 
 
 
558 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  45.28 
 
 
356 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  45.28 
 
 
356 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  50.92 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  51.13 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  40.7 
 
 
409 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  44.67 
 
 
408 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.34 
 
 
491 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.34 
 
 
491 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  38.65 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  37.13 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  35.69 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  45.81 
 
 
499 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  35.1 
 
 
423 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  40.1 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  40.1 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  40.1 
 
 
274 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.28 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.28 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  38.53 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  38.53 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  38.53 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  38.53 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  38.53 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  38.53 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  38.53 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  36.58 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.32 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  39.09 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  39.09 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  39.09 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  34.85 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.32 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  37.03 
 
 
473 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  39.55 
 
 
473 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  44.56 
 
 
502 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  36.41 
 
 
472 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  37.24 
 
 
471 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.49 
 
 
370 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.52 
 
 
459 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  38.19 
 
 
353 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.32 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  35.2 
 
 
559 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  35.12 
 
 
458 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.53 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.99 
 
 
805 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  33.33 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3039  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.23 
 
 
269 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>