85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4325 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  100 
 
 
484 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  54.95 
 
 
534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  55.22 
 
 
533 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  54.67 
 
 
517 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  54.67 
 
 
516 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  54.67 
 
 
519 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  53.11 
 
 
635 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  52.59 
 
 
535 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  48.48 
 
 
601 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  46.51 
 
 
527 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  50.45 
 
 
587 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  49.74 
 
 
501 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  50.37 
 
 
527 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  48.26 
 
 
584 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  50.4 
 
 
562 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  50.4 
 
 
562 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  52.47 
 
 
561 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  50.51 
 
 
369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  50.5 
 
 
354 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  52.82 
 
 
499 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  48.47 
 
 
573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  52.51 
 
 
558 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  46.67 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  48.08 
 
 
336 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  48.08 
 
 
336 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  48.08 
 
 
336 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  43.57 
 
 
356 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  43.57 
 
 
356 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  43.87 
 
 
409 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  53.39 
 
 
502 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  38.05 
 
 
420 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  52.97 
 
 
436 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  52.97 
 
 
436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  52.97 
 
 
436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  45.25 
 
 
380 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  47.04 
 
 
389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  42.63 
 
 
471 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.79 
 
 
370 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  39.63 
 
 
450 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.78 
 
 
384 aa  156  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  42.35 
 
 
473 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  54.19 
 
 
419 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.4 
 
 
374 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.4 
 
 
354 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  40.05 
 
 
474 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  40.05 
 
 
474 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  40.05 
 
 
474 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40 
 
 
457 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  44.48 
 
 
408 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  39.9 
 
 
421 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  39.9 
 
 
421 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  39.9 
 
 
421 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  39.9 
 
 
421 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  39.9 
 
 
421 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  39.9 
 
 
421 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  39.9 
 
 
421 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.42 
 
 
385 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  36.56 
 
 
423 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  50.24 
 
 
429 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  41.97 
 
 
473 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  50.41 
 
 
903 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  40.26 
 
 
423 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  39 
 
 
459 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  39 
 
 
429 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  39.68 
 
 
278 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  36.36 
 
 
472 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  36.11 
 
 
274 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  51.87 
 
 
338 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.08 
 
 
361 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.27 
 
 
459 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.73 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  32.86 
 
 
559 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  93.33 
 
 
478 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  28.64 
 
 
458 aa  63.9  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.7 
 
 
249 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  43.33 
 
 
941 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.38 
 
 
269 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  41.42 
 
 
991 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  42.01 
 
 
913 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  44.85 
 
 
364 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  40.83 
 
 
1860 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  47.41 
 
 
828 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  37.42 
 
 
667 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>