87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1398 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  887    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  90.74 
 
 		 501 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  76.33 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  77.23 
 
 		 562 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  77.23 
 
 		 562 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  72.85 
 
 		 561 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  63.4 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  62.82 
 
 		 533 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  63.4 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  63.4 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  62.44 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  61.33 
 
 		 635 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4657  hypothetical protein  74.22 
 
 		 558 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000209495  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  57.87 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  52.09 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  51.51 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  54.57 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  46.03 
 
 		 587 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  45.56 
 
 		 601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  55.29 
 
 		 499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  53.85 
 
 		 408 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  57.28 
 
 		 502 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  46.13 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  46.45 
 
 		 354 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  45.5 
 
 		 584 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  45.48 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  44.51 
 
 		 427 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50.62 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50.62 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  40.47 
 
 		 573 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  45.92 
 
 		 389 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  47.49 
 
 		 356 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  47.49 
 
 		 356 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  41.83 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  46.25 
 
 		 336 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  46.25 
 
 		 336 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  46.25 
 
 		 336 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  45.21 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.79 
 
 		 384 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  43.18 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  45.67 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  45.67 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  45.67 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  40.28 
 
 		 423 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.74 
 
 		 374 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.74 
 
 		 354 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  39.15 
 
 		 423 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  41.67 
 
 		 473 aa  143  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  42.28 
 
 		 409 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.99 
 
 		 370 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  40.21 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  40.42 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  40.42 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  42.13 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  43.23 
 
 		 278 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  43.82 
 
 		 436 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  43.45 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  43.45 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  41.23 
 
 		 274 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.55 
 
 		 385 aa  123  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  52.94 
 
 		 338 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.13 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  37.18 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50.48 
 
 		 353 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  42.92 
 
 		 419 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  39.79 
 
 		 473 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  40.77 
 
 		 903 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  35.71 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.71 
 
 		 361 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  37.62 
 
 		 559 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  43.46 
 
 		 913 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  39.13 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  39.13 
 
 		 991 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  44.74 
 
 		 1860 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  73.24 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.67 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  38.38 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  39.08 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  40.52 
 
 		 941 aa  54.3  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  47.52 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>