87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2804 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2804  putative membrane protein, glycine-rich  100 
 
 
502 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1648  putative membrane protein, glycine-rich  89 
 
 
499 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.390567  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  64.13 
 
 
517 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  64.13 
 
 
516 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  64.13 
 
 
519 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  64.07 
 
 
534 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  64.22 
 
 
533 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  63.29 
 
 
635 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  61.37 
 
 
535 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1516  hypothetical protein  52.44 
 
 
562 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1036  hypothetical protein  52.44 
 
 
562 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00739986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  55.21 
 
 
527 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4325  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  53.28 
 
 
484 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  52.18 
 
 
527 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1492  triple helix repeat-containing collagen  53.91 
 
 
562 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000276986  hitchhiker  0.0000188028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0395  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  52.51 
 
 
478 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  53.88 
 
 
501 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1737  hypothetical protein  58.52 
 
 
561 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000644211 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2833  hypothetical protein  47.51 
 
 
369 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326589  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1081  putative lipoprotein  45.54 
 
 
587 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52375  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4242  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  51.97 
 
 
491 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4352  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  51.97 
 
 
491 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.852491 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0398  putative lipoprotein  44.8 
 
 
601 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2684  hypothetical protein  47.06 
 
 
354 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3857  putative lipoprotein  50.68 
 
 
356 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3971  putative lipoprotein  50.68 
 
 
356 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.224343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0516  putative lipoprotein  41.89 
 
 
573 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996857  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0090  putative lipoprotein  43.07 
 
 
584 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.887895  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03006  putative lipoprotein  46.79 
 
 
427 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  48.98 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3650  hemagglutinin-related transmembrane protein  44.35 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5403  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  43.89 
 
 
457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5644  hypothetical protein  49.1 
 
 
408 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4243  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.3 
 
 
374 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.613213  normal  0.280906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4353  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  46.3 
 
 
354 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.637133 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0107  putative lipoprotein  44.12 
 
 
336 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1250  putative lipoprotein  44.12 
 
 
336 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1529  putative lipoprotein  44.12 
 
 
336 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  50.47 
 
 
385 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2341  hypothetical protein  51.82 
 
 
389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3040  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  49.68 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697137  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1738  hypothetical protein  42.86 
 
 
450 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726396  hitchhiker  0.0000436942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2549  putative lipoprotein  42.54 
 
 
420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.654322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1515  hypothetical protein  41.26 
 
 
474 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00333219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1491  hypothetical protein  41.26 
 
 
474 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0249201  hitchhiker  0.0000141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1035  hypothetical protein  41.26 
 
 
474 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00276932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0158  putative lipoprotein  41.08 
 
 
421 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1008  putative lipoprotein  41.08 
 
 
421 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1782  putative lipoprotein  41.08 
 
 
421 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1760  putative lipoprotein  41.08 
 
 
421 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.871561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1043  putative lipoprotein  41.08 
 
 
421 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0545117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1490  putative lipoprotein  41.08 
 
 
421 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1397  hypothetical protein  39.66 
 
 
423 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1932  putative lipoprotein  41.08 
 
 
421 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3565  triple helix repeat-containing collagen  41.72 
 
 
429 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  0.0384386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1437  hypothetical protein  39.08 
 
 
423 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602392  normal  0.0837865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1647  putative membrane protein, glycine-rich  43.16 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5407  triple helix repeat-containing collagen  42.51 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686905  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4656  hypothetical protein  42.41 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00484705  normal  0.0341198 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5849  triple helix repeat-containing collagen  40.83 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4455  triple helix repeat-containing collagen  40.83 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5404  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  37.57 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.809813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3860  lipoprotein  46.13 
 
 
436 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.532791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4702  triple helix repeat-containing collagen  46.13 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3661  triple helix repeat-containing collagen  46.13 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914344  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02600  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  41.84 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.680742  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4352  triple helix repeat-containing collagen  38.73 
 
 
393 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1475  hypothetical protein  44.59 
 
 
278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0920778  normal  0.183945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2797  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  44.48 
 
 
361 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0117938  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2805  putative membrane protein, glycine-rich  41.46 
 
 
473 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.227695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4059  putative lipoprotein  44.04 
 
 
338 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3913  triple helix repeat-containing collagen  40.89 
 
 
274 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2447  lipoprotein  42.92 
 
 
419 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4172  triple helix repeat-containing collagen  36.08 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5047  triple helix repeat-containing collagen  40.4 
 
 
903 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_003296  RS02599  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  40.98 
 
 
353 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.645322  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0653  hypothetical protein  38.5 
 
 
559 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1654  hypothetical protein  37.37 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0304713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2796  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.62 
 
 
249 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2629  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  42.07 
 
 
269 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.819782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0977  triple helix repeat-containing collagen  61.19 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  40.72 
 
 
828 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  40.72 
 
 
991 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  40.72 
 
 
913 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  41.95 
 
 
941 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3039  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  53.33 
 
 
269 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  43.17 
 
 
1860 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.116174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>