More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3981 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3761  AAA ATPase central domain protein  93.84 
 
 
438 aa  830    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3981  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  951    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3062  ATPase central domain-containing protein  48.17 
 
 
440 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.584274  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3406  AAA ATPase, central region  39.56 
 
 
445 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2183  AAA ATPase central domain protein  44.02 
 
 
360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.681506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2258  ATPase central domain-containing protein  36.73 
 
 
360 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.47 
 
 
806 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.67 
 
 
754 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.11 
 
 
754 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.93 
 
 
739 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  37.17 
 
 
754 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  39.77 
 
 
585 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.91 
 
 
757 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.78 
 
 
754 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.22 
 
 
756 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.78 
 
 
763 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.27 
 
 
852 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  35.96 
 
 
317 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  32.59 
 
 
699 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.48 
 
 
808 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.56 
 
 
804 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
743 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  36.16 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  34.91 
 
 
746 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  33.91 
 
 
776 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.36 
 
 
801 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
742 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.5 
 
 
805 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  34.08 
 
 
739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.6 
 
 
727 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.18 
 
 
731 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.43 
 
 
736 aa  121  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  29.58 
 
 
866 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.89 
 
 
742 aa  120  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  32.47 
 
 
607 aa  120  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  35.91 
 
 
514 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32 
 
 
754 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  33.63 
 
 
393 aa  119  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
769 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.44 
 
 
740 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  30.67 
 
 
722 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.76 
 
 
723 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.75 
 
 
781 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.74 
 
 
736 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.76 
 
 
732 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.94 
 
 
735 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.46 
 
 
759 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.22 
 
 
738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  33.19 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
768 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.16 
 
 
715 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.82 
 
 
737 aa  118  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.99 
 
 
731 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.77 
 
 
800 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.49 
 
 
731 aa  117  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.44 
 
 
740 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.3 
 
 
721 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.92 
 
 
775 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  28.31 
 
 
713 aa  117  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.16 
 
 
801 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.75 
 
 
781 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.6 
 
 
718 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.62 
 
 
810 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.62 
 
 
731 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.19 
 
 
784 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  33.04 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  31.14 
 
 
814 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  33.93 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  33.93 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.2 
 
 
760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
810 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  36.4 
 
 
703 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.65 
 
 
709 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.46 
 
 
738 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  34.43 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
598 aa  114  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  31.56 
 
 
386 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  31.7 
 
 
405 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  31.33 
 
 
804 aa  113  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
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NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  32.67 
 
 
599 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
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NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  31.3 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
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NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.78 
 
 
701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  33.19 
 
 
417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
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NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.44 
 
 
805 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31 
 
 
704 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  32.14 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  33.48 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.3 
 
 
718 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
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NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  33.19 
 
 
438 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  29.93 
 
 
764 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
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NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.5 
 
 
577 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
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NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  31.88 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
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NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.43 
 
 
719 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.44 
 
 
772 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  33.77 
 
 
412 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
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NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  29.63 
 
 
806 aa  109  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
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NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.63 
 
 
737 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  32.31 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
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NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.12 
 
 
738 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
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