More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2183 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2183  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
360 aa  744    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.681506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2258  ATPase central domain-containing protein  67.22 
 
 
360 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3062  ATPase central domain-containing protein  44.29 
 
 
440 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.584274  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3761  AAA ATPase central domain protein  39.86 
 
 
438 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3981  ATPase central domain-containing protein  44.02 
 
 
471 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3406  AAA ATPase, central region  36.58 
 
 
445 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  30.22 
 
 
599 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  29.48 
 
 
607 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  29.21 
 
 
776 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  31.45 
 
 
585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  30.08 
 
 
829 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.82 
 
 
742 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.65 
 
 
736 aa  116  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.25 
 
 
781 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.88 
 
 
731 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.53 
 
 
718 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.42 
 
 
731 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.2 
 
 
743 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.44 
 
 
731 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.88 
 
 
800 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.3 
 
 
732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.88 
 
 
781 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  29.27 
 
 
814 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.2 
 
 
740 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.88 
 
 
784 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  31.09 
 
 
810 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.7 
 
 
731 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 
673 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 
673 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.45 
 
 
735 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  32.77 
 
 
394 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  31.43 
 
 
410 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27 
 
 
739 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  31.39 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  31.75 
 
 
405 aa  109  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.85 
 
 
723 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  31.94 
 
 
407 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.88 
 
 
737 aa  110  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.72 
 
 
769 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.71 
 
 
667 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  29.83 
 
 
412 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  32.39 
 
 
713 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.17 
 
 
727 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.93 
 
 
852 aa  109  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  31.94 
 
 
407 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.67 
 
 
760 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  31.94 
 
 
407 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.23 
 
 
738 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  32.53 
 
 
379 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  26.27 
 
 
804 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  31.78 
 
 
803 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  29.53 
 
 
550 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  32.63 
 
 
421 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.51 
 
 
737 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  28.99 
 
 
426 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  35.11 
 
 
629 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  34.95 
 
 
624 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.51 
 
 
808 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  36.32 
 
 
514 aa  106  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  31.23 
 
 
412 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  30.56 
 
 
718 aa  106  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  32.5 
 
 
464 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.8 
 
 
759 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  31.88 
 
 
624 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  31.98 
 
 
317 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  34.65 
 
 
615 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  32.08 
 
 
618 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.05 
 
 
740 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  28.51 
 
 
746 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  31.02 
 
 
410 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  26.33 
 
 
866 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.52 
 
 
806 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  29.96 
 
 
620 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  34.65 
 
 
615 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  30.77 
 
 
431 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.41 
 
 
715 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  30.37 
 
 
405 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  28.35 
 
 
739 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 
646 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 
646 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  30.83 
 
 
605 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  28.03 
 
 
400 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.83 
 
 
605 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  32.64 
 
 
620 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.84 
 
 
742 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.84 
 
 
721 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  34.27 
 
 
414 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.37 
 
 
756 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 
624 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  32.12 
 
 
635 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  29.95 
 
 
703 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  32.82 
 
 
625 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  32.64 
 
 
620 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.12 
 
 
783 aa  102  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.51 
 
 
627 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  30 
 
 
619 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.91 
 
 
754 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  32.12 
 
 
620 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.37 
 
 
772 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  29.83 
 
 
429 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>