More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4515 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4515  ABC transporter-related protein  100 
 
 
257 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.483028  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4528  ABC transporter related  75.9 
 
 
268 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  51.63 
 
 
276 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
281 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  44.3 
 
 
254 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
268 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 
274 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  46.9 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
265 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  41.43 
 
 
267 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 
271 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  43.15 
 
 
271 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  44.54 
 
 
267 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  43.29 
 
 
285 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.49 
 
 
257 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.13 
 
 
337 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  40.73 
 
 
278 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
277 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.25 
 
 
276 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  42.5 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  39.36 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.86 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.19 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  44.4 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  43.6 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.34 
 
 
251 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  43.44 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  41.26 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  45.63 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  43.91 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  47.39 
 
 
258 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  45.54 
 
 
268 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  43.6 
 
 
284 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.87 
 
 
257 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  45.41 
 
 
283 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  42.44 
 
 
261 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 
267 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  41.28 
 
 
265 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  43.86 
 
 
244 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  45.61 
 
 
252 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
261 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  41.85 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  44.02 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  41.85 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
282 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  44.49 
 
 
244 aa  179  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  48.65 
 
 
252 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  46.85 
 
 
288 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  38.43 
 
 
284 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.24 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  48.15 
 
 
266 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  45.41 
 
 
282 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
256 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.36 
 
 
292 aa  178  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
290 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.52 
 
 
266 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.23 
 
 
293 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  39.55 
 
 
265 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.68 
 
 
267 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
267 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.66 
 
 
280 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
267 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 
264 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  43.21 
 
 
259 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  42.86 
 
 
264 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  45.19 
 
 
263 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.26 
 
 
278 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  43.23 
 
 
293 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  40.49 
 
 
244 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  38.11 
 
 
267 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.64 
 
 
324 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.33 
 
 
256 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  42.61 
 
 
274 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.1 
 
 
287 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  39.3 
 
 
269 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.21 
 
 
279 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 
271 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  42.32 
 
 
264 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.3 
 
 
265 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.79 
 
 
667 aa  175  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  43.72 
 
 
270 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
270 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6161  ABC transporter related  42.55 
 
 
287 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  43.93 
 
 
261 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  47.53 
 
 
245 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.57 
 
 
326 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
267 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 
264 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.39 
 
 
263 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.57 
 
 
301 aa  174  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  47.87 
 
 
353 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.83 
 
 
280 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.83 
 
 
280 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.33 
 
 
277 aa  174  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 
261 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.89 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>