More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4528 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4528  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4515  ABC transporter-related protein  75.9 
 
 		 257 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.483028  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  46.15 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.35 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.5 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.61 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.91 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  42.91 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  47.86 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  44.49 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.62 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.67 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  40.41 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  42.02 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.57 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.13 
 
 		 266 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  39.44 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.45 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.91 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  40.64 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  40.23 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 278 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.41 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  43.95 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.61 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  39.92 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  42.56 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.57 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  45.2 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  40.32 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0995  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.91 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.57 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.3 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.57 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  48.43 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  43.15 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  40.82 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  38.87 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.81 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  39.34 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.24 
 
 		 263 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  45.73 
 
 		 261 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 282 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.77 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.64 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.32 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  43.86 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  41.85 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.81 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.22 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.86 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.95 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  37.31 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  39.83 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  40.8 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  42.02 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  40.87 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.81 
 
 		 667 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  41.7 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  44.75 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  39.29 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.05 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  40.66 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  46.92 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.61 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  43.61 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.16 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.62 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  41.06 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.42 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  46.22 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6161  ABC transporter related  45.06 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.6 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  40.32 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.54 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.87 
 
 		 573 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  42.06 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>