More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3120 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013207  Aaci_3120  type II secretion system protein E  100 
 
 
499 aa  1035    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0580  type II secretion system protein E  93.39 
 
 
497 aa  964    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  29.25 
 
 
463 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  26.88 
 
 
444 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  28.87 
 
 
462 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  28.43 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  28.25 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  28.28 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  28.28 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  26.42 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.24 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  28.5 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  27.67 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  28.81 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  26.65 
 
 
477 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.66 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  28.74 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  26.88 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  27.2 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  28.78 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  28.86 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  28.99 
 
 
624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.74 
 
 
451 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  27.62 
 
 
472 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  28.41 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  28.81 
 
 
498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  25.82 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  29.65 
 
 
515 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  30 
 
 
438 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  28.47 
 
 
457 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  28.91 
 
 
458 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.76 
 
 
469 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  25.78 
 
 
449 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
454 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  27.79 
 
 
477 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  28.16 
 
 
442 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  29.06 
 
 
454 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  28.78 
 
 
437 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  27.86 
 
 
480 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  30.75 
 
 
437 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  26.59 
 
 
478 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  29.72 
 
 
478 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  28.02 
 
 
459 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  29.38 
 
 
521 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  29.38 
 
 
520 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  29.89 
 
 
472 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  29.38 
 
 
523 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  29.89 
 
 
472 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  29.38 
 
 
520 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  29.38 
 
 
523 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  29.38 
 
 
520 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30.32 
 
 
474 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.3 
 
 
408 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.05 
 
 
468 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  28.54 
 
 
455 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  29.85 
 
 
456 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  28.54 
 
 
455 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  29.6 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  28.54 
 
 
455 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  28.73 
 
 
491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  25.66 
 
 
589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  27.73 
 
 
446 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  28.5 
 
 
452 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  26.33 
 
 
476 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  28.45 
 
 
491 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  28.37 
 
 
455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  26.44 
 
 
569 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  26.37 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  27.99 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  30.24 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  29.36 
 
 
521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  29.68 
 
 
488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  27.43 
 
 
483 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.44 
 
 
481 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  27.99 
 
 
455 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  26.59 
 
 
473 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  28.36 
 
 
482 aa  120  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  27.25 
 
 
485 aa  120  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  28.36 
 
 
485 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  26.05 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  27.6 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  28.36 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  25.73 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.11 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  27.75 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  26.8 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  27.7 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  27.75 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  27.75 
 
 
454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0882  type II secretion system protein E  25.24 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  27.43 
 
 
482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  27.4 
 
 
455 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  27.63 
 
 
463 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  26.8 
 
 
742 aa  117  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  29.56 
 
 
438 aa  116  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  26.73 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  25.27 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  27.57 
 
 
492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  28.36 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  28.49 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>