226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2603 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  703    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  41.52 
 
 
358 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  34.85 
 
 
351 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  36.95 
 
 
340 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  33.97 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  36.51 
 
 
320 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
339 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  34.74 
 
 
331 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
317 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  34.25 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  33.79 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
325 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  34.09 
 
 
338 aa  159  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
319 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  31.88 
 
 
326 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  35.62 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  35.35 
 
 
330 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
326 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  32.41 
 
 
336 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  32.41 
 
 
336 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  34.56 
 
 
331 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
364 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.58 
 
 
350 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.37 
 
 
345 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.74 
 
 
353 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
366 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.08 
 
 
313 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.89 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.47 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.94 
 
 
381 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
350 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  26.13 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.37 
 
 
629 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  29.13 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  30 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.83 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.04 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.71 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.34 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.69 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.93 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.93 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.64 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.06 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  22.56 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  27.34 
 
 
353 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.86 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25.66 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.88 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  25.7 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.48 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  25.35 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  26.84 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.05 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.4 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.33 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  23.75 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.75 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  25.28 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  24.63 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>