More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1949 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  95.16 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 193 aa  167  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 600 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  34.73 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 198 aa  98.6  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  32.6 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  29.21 
 
 		 176 aa  91.3  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  32.08 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  23.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  28.99 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  22.35 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  20.47 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>