More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1015 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl1015  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1108    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3254  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.73 
 
 		 364 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5150  RNA-directed DNA polymerase  39.24 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2352  RNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 594 aa  229  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0934  Ribonuclease H  35.53 
 
 		 568 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0735383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1389  RNA-directed DNA polymerase  31.72 
 
 		 632 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297268  normal  0.184717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.05 
 
 		 598 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3648  ribonuclease H  37.04 
 
 		 563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4096  RNA-directed DNA polymerase  30.56 
 
 		 503 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.559536  decreased coverage  0.00132116 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2277  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.37 
 
 		 338 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2238  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.37 
 
 		 338 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2145  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.86 
 
 		 482 aa  153  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1568  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0018  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.01 
 
 		 451 aa  136  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0160  RNA-directed DNA polymerase  34.5 
 
 		 658 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.409193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00831  retron EC86 RNA-directed DNA polymerase-like protein  32.28 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00839  hypothetical protein  32.28 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6590  hypothetical protein  29.18 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923372  normal  0.0775109 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6108  hypothetical protein  29.18 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5744  hypothetical protein  29.18 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6088  hypothetical protein  28.8 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3095  hypothetical protein  28.97 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138742  decreased coverage  0.0000000261203 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1151  retron-type reverse transcriptase  31.51 
 
 		 482 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7580  hypothetical protein  29.2 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0004  RNA-directed DNA polymerase  30.15 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00169574  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2444  hypothetical protein  29.37 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2043  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.97 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1363  RNA-directed DNA polymerase  28.47 
 
 		 380 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0800  RNA-directed DNA polymerase  27.61 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.725182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1181  RNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004302  putative reverse transcriptase  26.52 
 
 		 321 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3135  putative reverse transcriptase  32.51 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1473  retron reverse transcriptase  25 
 
 		 323 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4833  hypothetical protein  30.16 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3418  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.92 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.339292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3225  hypothetical protein  30.27 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1202  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.45 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1962  RNA-directed DNA polymerase  27.99 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0502  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.35 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  32 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  30.64 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  29.45 
 
 		 488 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  32 
 
 		 485 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3598  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  29.59 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  30.64 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  32.19 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  33.56 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1440  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.6 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1397  retron reverse transcriptase  25.46 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  33.56 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0293  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.26 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.127138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  28.99 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4176  hypothetical protein  28 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.91144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  28.07 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  28.4 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  28.07 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  28.65 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.37 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3930  retron reverse transcriptase  26.98 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  29.47 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  29.47 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  30.52 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  30.68 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  30.99 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  27.49 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.82 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  32.8 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  27.68 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  27.81 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2428  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.75 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464026  normal  0.0789669 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  28.08 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.4 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  30.72 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  29.93 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  29.82 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  32.65 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  31.29 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  27.68 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  31.97 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  31.29 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  28.57 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  31.72 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  30.18 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  31.97 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  31.29 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  29.49 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  31.29 
 
 		 503 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  31.29 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  27.81 
 
 		 496 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  28.82 
 
 		 503 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  31.29 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  26.37 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1333  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  31.29 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  27.22 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  31.29 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>