51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5744 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6590  hypothetical protein  96.65 
 
 		 449 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923372  normal  0.0775109 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7580  hypothetical protein  88.26 
 
 		 479 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6108  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  890    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6088  hypothetical protein  80.81 
 
 		 479 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5744  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  890    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0018  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  62.13 
 
 		 451 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2444  hypothetical protein  47.72 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3095  hypothetical protein  42.2 
 
 		 440 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138742  decreased coverage  0.0000000261203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2043  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.59 
 
 		 446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2145  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.06 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1389  RNA-directed DNA polymerase  41.69 
 
 		 632 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297268  normal  0.184717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.58 
 
 		 598 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1568  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.38 
 
 		 449 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4096  RNA-directed DNA polymerase  36.96 
 
 		 503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.559536  decreased coverage  0.00132116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0160  RNA-directed DNA polymerase  44.36 
 
 		 658 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1151  retron-type reverse transcriptase  33.13 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1181  RNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0800  RNA-directed DNA polymerase  29.36 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.725182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1015  hypothetical protein  29.18 
 
 		 541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2277  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.91 
 
 		 338 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2238  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.91 
 
 		 338 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5150  RNA-directed DNA polymerase  31.44 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2352  RNA-directed DNA polymerase  27.84 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1363  RNA-directed DNA polymerase  28.38 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3254  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.9 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0934  Ribonuclease H  30.32 
 
 		 568 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0735383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0004  RNA-directed DNA polymerase  30.82 
 
 		 324 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00169574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3648  ribonuclease H  26.35 
 
 		 563 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620848  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00831  retron EC86 RNA-directed DNA polymerase-like protein  27.35 
 
 		 320 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00839  hypothetical protein  27.35 
 
 		 320 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004302  putative reverse transcriptase  26.29 
 
 		 321 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1202  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.11 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1473  retron reverse transcriptase  27.27 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0293  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.34 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.127138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3418  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.8 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.339292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3930  retron reverse transcriptase  22.9 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1397  retron reverse transcriptase  26.76 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2428  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.02 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464026  normal  0.0789669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2611  retron-type reverse transcriptase  26.22 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1962  RNA-directed DNA polymerase  24.09 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3598  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  29.19 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1440  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2371  reverse transcriptase  20.07 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4833  hypothetical protein  24.77 
 
 		 339 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1348  retron reverse transcriptase  27.13 
 
 		 169 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4176  hypothetical protein  28.18 
 
 		 307 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.91144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4614  putative recombinase  29.61 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179717  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6534  putative reverse transcriptasematurase of intron  28.18 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0483  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.77 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3135  putative reverse transcriptase  27.34 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0883  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.81 
 
 		 466 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00469922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>