50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6590 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6590  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  887    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923372  normal  0.0775109 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7580  hypothetical protein  88.71 
 
 		 479 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6108  hypothetical protein  96.65 
 
 		 449 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6088  hypothetical protein  82.17 
 
 		 479 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5744  hypothetical protein  96.65 
 
 		 449 aa  832    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0018  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  61.68 
 
 		 451 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2444  hypothetical protein  48.02 
 
 		 415 aa  265  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3095  hypothetical protein  42.2 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138742  decreased coverage  0.0000000261203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2043  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.77 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2145  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.45 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1389  RNA-directed DNA polymerase  41.04 
 
 		 632 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297268  normal  0.184717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.42 
 
 		 598 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1568  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.07 
 
 		 449 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4096  RNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.559536  decreased coverage  0.00132116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0160  RNA-directed DNA polymerase  43.98 
 
 		 658 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1151  retron-type reverse transcriptase  33.13 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1181  RNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1015  hypothetical protein  29.18 
 
 		 541 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0800  RNA-directed DNA polymerase  29.35 
 
 		 377 aa  126  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.725182 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2277  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.25 
 
 		 338 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2238  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.25 
 
 		 338 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5150  RNA-directed DNA polymerase  31.77 
 
 		 584 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2352  RNA-directed DNA polymerase  27.84 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1363  RNA-directed DNA polymerase  28.38 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3254  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.97 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0934  Ribonuclease H  29.6 
 
 		 568 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0735383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3648  ribonuclease H  26.35 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0004  RNA-directed DNA polymerase  30.82 
 
 		 324 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00169574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00831  retron EC86 RNA-directed DNA polymerase-like protein  27.35 
 
 		 320 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00839  hypothetical protein  27.35 
 
 		 320 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004302  putative reverse transcriptase  25.08 
 
 		 321 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1202  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.22 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1473  retron reverse transcriptase  26.86 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0293  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.21 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.127138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3418  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.8 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.339292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3930  retron reverse transcriptase  23.23 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1397  retron reverse transcriptase  26.76 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2428  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.02 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464026  normal  0.0789669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2611  retron-type reverse transcriptase  26.22 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1962  RNA-directed DNA polymerase  24.09 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3598  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  28.83 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1440  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2371  reverse transcriptase  19.72 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4833  hypothetical protein  23.44 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1348  retron reverse transcriptase  27.13 
 
 		 169 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4176  hypothetical protein  28.18 
 
 		 307 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.91144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4614  putative recombinase  27.65 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179717  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6534  putative reverse transcriptasematurase of intron  27.65 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3135  putative reverse transcriptase  27.34 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0483  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.43 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>