40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4176 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.91144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4833  hypothetical protein  41.64 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0004  RNA-directed DNA polymerase  25.5 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00169574  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1015  hypothetical protein  28 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2352  RNA-directed DNA polymerase  23.88 
 
 		 594 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1440  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.75 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1473  retron reverse transcriptase  29.25 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2043  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.29 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1348  retron reverse transcriptase  30.48 
 
 		 169 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3254  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.33 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1397  retron reverse transcriptase  24.79 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5150  RNA-directed DNA polymerase  25.79 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2238  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.26 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2277  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.26 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1202  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.32 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0934  Ribonuclease H  31.52 
 
 		 568 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0735383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3648  ribonuclease H  22.91 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00839  hypothetical protein  24.44 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4096  RNA-directed DNA polymerase  22.26 
 
 		 503 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.559536  decreased coverage  0.00132116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6088  hypothetical protein  29.44 
 
 		 479 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00831  retron EC86 RNA-directed DNA polymerase-like protein  24.44 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3598  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  26.49 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3930  retron reverse transcriptase  21.98 
 
 		 393 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2145  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.11 
 
 		 482 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7580  hypothetical protein  27.93 
 
 		 479 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27 
 
 		 598 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1568  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25 
 
 		 449 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6108  hypothetical protein  28.18 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0160  RNA-directed DNA polymerase  26.58 
 
 		 658 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6590  hypothetical protein  28.18 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923372  normal  0.0775109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5744  hypothetical protein  28.18 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1363  RNA-directed DNA polymerase  23.36 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3095  hypothetical protein  24.82 
 
 		 440 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138742  decreased coverage  0.0000000261203 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0293  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.1 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.127138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1389  RNA-directed DNA polymerase  26.05 
 
 		 632 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297268  normal  0.184717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004302  putative reverse transcriptase  22.66 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3418  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.83 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.339292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0502  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.61 
 
 		 400 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2444  hypothetical protein  26.35 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2428  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.46 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464026  normal  0.0789669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>