More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3419 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  100 
 
 		 523 aa  1061    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  57.57 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  48.45 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  37.33 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  36.14 
 
 		 433 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 508 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 692 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  35.5 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  35.26 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  33.03 
 
 		 452 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  32.6 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  29.91 
 
 		 499 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  27.73 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  28.63 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  32.09 
 
 		 449 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  27.48 
 
 		 412 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  29.2 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  33.21 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  27.8 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  29.71 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 624 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  27.86 
 
 		 474 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.5 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 459 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  27.13 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 492 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  28 
 
 		 508 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 462 aa  124  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 463 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 491 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 430 aa  123  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  31.44 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  27.23 
 
 		 638 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.39 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.15 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  27.81 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  29.15 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  26.63 
 
 		 515 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  32.12 
 
 		 469 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  27.5 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  26.37 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  30.72 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  26.37 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  26.37 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  26.37 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  26.37 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.82 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 488 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 489 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 484 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  26.76 
 
 		 451 aa  120  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 482 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  28.81 
 
 		 492 aa  120  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  29.08 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  29.3 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  31.79 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.22 
 
 		 594 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  25.51 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.4 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.75 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  26.03 
 
 		 480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  26.11 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  27.59 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  26.69 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  25.79 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  30.26 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  26.1 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  27.06 
 
 		 469 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  28.51 
 
 		 498 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 483 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>