More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2604 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
871 aa  1634    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  49.05 
 
 
859 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  41.08 
 
 
878 aa  490  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  46.4 
 
 
857 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  43.11 
 
 
855 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.06 
 
 
880 aa  382  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  31.04 
 
 
897 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  38.16 
 
 
846 aa  315  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  37.16 
 
 
846 aa  312  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.26 
 
 
835 aa  290  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  34.45 
 
 
841 aa  288  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.96 
 
 
855 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.67 
 
 
838 aa  254  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.12 
 
 
836 aa  253  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.31 
 
 
843 aa  245  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  32.95 
 
 
825 aa  241  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.23 
 
 
848 aa  232  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.52 
 
 
842 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
861 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.69 
 
 
847 aa  211  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  32.51 
 
 
839 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
856 aa  207  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27.81 
 
 
854 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  31.34 
 
 
845 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 
852 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
873 aa  194  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 
859 aa  177  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  30.16 
 
 
861 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  29.28 
 
 
849 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  33.8 
 
 
930 aa  172  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 
806 aa  164  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  35.38 
 
 
828 aa  157  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  29.29 
 
 
849 aa  156  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 
853 aa  144  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.44 
 
 
858 aa  134  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
853 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.39 
 
 
857 aa  121  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.35 
 
 
855 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
866 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  32.54 
 
 
853 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  51.31 
 
 
738 aa  109  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  27.71 
 
 
854 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.01 
 
 
857 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.66 
 
 
858 aa  105  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.54 
 
 
850 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  19.61 
 
 
833 aa  105  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.99 
 
 
863 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 
849 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  32.98 
 
 
488 aa  93.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.52 
 
 
849 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.28 
 
 
822 aa  91.3  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.37 
 
 
856 aa  89.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 
857 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  19.47 
 
 
850 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.64 
 
 
851 aa  88.2  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.42 
 
 
855 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  44.88 
 
 
873 aa  85.9  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 
855 aa  84.7  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  45.19 
 
 
834 aa  84.7  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  26.64 
 
 
855 aa  84.3  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  23.48 
 
 
794 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  44 
 
 
821 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.79 
 
 
850 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.49 
 
 
827 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 
847 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.22 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
801 aa  75.1  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 
847 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.15 
 
 
896 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 
835 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.66 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  26.77 
 
 
846 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  18.46 
 
 
684 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  50 
 
 
826 aa  71.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  20.39 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  26.47 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  26.47 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  26.47 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  26.47 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  26.47 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  27.71 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  23.98 
 
 
829 aa  68.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  40.31 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  17.85 
 
 
829 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.76 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.44 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  17.85 
 
 
829 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.96 
 
 
870 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  23.84 
 
 
813 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  28.26 
 
 
885 aa  67  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  39.87 
 
 
643 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 
822 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.39 
 
 
417 aa  67  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>