150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2451 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 271 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  60.37 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  57.2 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  48.34 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  57.56 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  46.47 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.28 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  42.64 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  41.24 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  36.9 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.75 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  38.75 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  38.01 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  39.09 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  36.56 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.73 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  42.54 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  37.12 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  37.45 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  36.86 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.9 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.15 
 
 		 445 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  35.2 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  33.82 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  38.01 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  36.94 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.8 
 
 		 446 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.19 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.19 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.19 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  37.88 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.29 
 
 		 445 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 449 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.02 
 
 		 448 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  37.36 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.18 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.86 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.16 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  28.1 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  39.05 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.72 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.25 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  26.54 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  27.45 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.08 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.27 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  29.19 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  29.19 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.73 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  30.43 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 		 188 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.5 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  40 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  37.68 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  26.35 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  36.47 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21430  ATP synthase, F1 delta subunit  27.21 
 
 		 191 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 		 182 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 178 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.21 
 
 		 179 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.67 
 
 		 182 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  26.99 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  33.13 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  36.23 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  40.54 
 
 		 135 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  34.15 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  38.81 
 
 		 118 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  25.57 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  24.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  36.23 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.68 
 
 		 180 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  21.39 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.86 
 
 		 178 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  33.75 
 
 		 177 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 182 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 		 182 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.54 
 
 		 186 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  24.12 
 
 		 176 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  28 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>