238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21430 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21430  ATP synthase, F1 delta subunit  100 
 
 
191 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1042  ATP synthase F1, delta subunit  56.77 
 
 
192 aa  197  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  0.0874867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12080  ATP synthase, F1 delta subunit  46.35 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  28.07 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.18 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  27.95 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.05 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.45 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.13 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.13 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.77 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.6 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  27.07 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.42 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.56 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1301  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  31.71 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.180906  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.77 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.77 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.87 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  27.62 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.35 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.45 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.05 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  27.85 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.41 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.05 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  25.99 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  25.99 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  27.21 
 
 
271 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.56 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.65 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  28.33 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.77 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.11 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.35 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  26.44 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  26.83 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  27.13 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  28.83 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
180 aa  57.8  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  25.84 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  23.76 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  28.11 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.53 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  24.56 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.72 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.38 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.65 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  27.11 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.53 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.83 
 
 
445 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.54 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  25.68 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  24.31 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  26.97 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  26.37 
 
 
190 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  20.12 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.29 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>