101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12080 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12080  ATP synthase, F1 delta subunit  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1042  ATP synthase F1, delta subunit  54.17 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  0.0874867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21430  ATP synthase, F1 delta subunit  46.35 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.57 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.28 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.84 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  26.06 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  25.43 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1301  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  36.73 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.180906  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  24.12 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  27.59 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.31 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.41 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  25.43 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.13 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  25 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  23.03 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  26.92 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.56 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.65 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  25.47 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.18 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  25.44 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.78 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1936  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.52 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  24.14 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.9 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.52 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.23 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  24.14 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  25.44 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.76 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.84 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.33 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.43 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  30.28 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  26.61 
 
 		 184 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  28.79 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  25.32 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.68 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  24 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  24.82 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  32.63 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  22.14 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.26 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  25.6 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.03 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  27.07 
 
 		 276 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  22.99 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  22.99 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.86 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.21 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.33 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.4 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.21 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.21 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.21 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.92 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  30.77 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0860  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  22.73 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1699  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.08 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.315472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0293  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.74 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  24.43 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  30.61 
 
 		 178 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.61 
 
 		 178 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.61 
 
 		 178 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  25.28 
 
 		 190 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 		 178 aa  42  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.29 
 
 		 180 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 180 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  24.85 
 
 		 192 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.61 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.02 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.83 
 
 		 274 aa  41.6  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.61 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.61 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  31.96 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>