218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0860 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0860  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
178 aa  358  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0518  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.94 
 
 
178 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1936  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.13 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  30.23 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  26.95 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.8 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.26 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  32.93 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.95 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  24.55 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  24.26 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  27.17 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.37 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.28 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.86 
 
 
186 aa  61.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  30.23 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  25.42 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  24 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  25.42 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  23.73 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  23.6 
 
 
180 aa  58.2  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  23.73 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  26.35 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.7 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
180 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  27.75 
 
 
178 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  26.29 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.53 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.69 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.69 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.69 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  25.41 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  26.26 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  25.33 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.6 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  24.02 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.73 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.54 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.16 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.21 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  24.12 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.43 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.07 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.07 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  23.33 
 
 
217 aa  54.7  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.07 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.07 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.07 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  22.29 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1712  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.93 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.21 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  24.72 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.21 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0149  ATP synthase F1, delta subunit  27.54 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  23.33 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.46 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.56 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.33 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.22 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.54 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  23.86 
 
 
194 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>