209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1936 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1936  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
175 aa  340  5.999999999999999e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0860  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.13 
 
 
178 aa  87.8  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0518  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.49 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  26.9 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  28.75 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  26.47 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  31.29 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  27.06 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  26.38 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  24.1 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  26.25 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  26.9 
 
 
188 aa  61.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  26.44 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
188 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.98 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  26.14 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  25.44 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  26.47 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  25.15 
 
 
179 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.35 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  26.47 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
188 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  28.31 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  29.45 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.09 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  25.88 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.29 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.06 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  25.29 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  27.68 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.55 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  26.19 
 
 
189 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  27.11 
 
 
201 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 
182 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
184 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  24.85 
 
 
179 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
178 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 
182 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.16 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  24.12 
 
 
178 aa  52  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  24.54 
 
 
194 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
181 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.39 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  24.18 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.69 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.12 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.24 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  28.74 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  25.43 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2810  ATP synthase F1, delta subunit  23.53 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.706579  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  26.95 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3206  ATP synthase F1, delta subunit  23.53 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.29 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.29 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.29 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0656  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0940126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.7 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  25.29 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  25.88 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.54 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>