135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1301 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1301  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  100 
 
 
157 aa  318  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.180906  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21430  ATP synthase, F1 delta subunit  31.71 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1042  ATP synthase F1, delta subunit  37.39 
 
 
192 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  0.0874867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.11 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.67 
 
 
179 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  32.22 
 
 
185 aa  60.8  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  32.22 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.52 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  30.3 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  32.32 
 
 
184 aa  58.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12080  ATP synthase, F1 delta subunit  36.73 
 
 
192 aa  57.4  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.65 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.3 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
179 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  33.75 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.7 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  28.3 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0518  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.36 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
177 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  24.53 
 
 
192 aa  51.2  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.75 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.12 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.2 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  31.87 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  31.11 
 
 
182 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.76 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.35 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
180 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.84 
 
 
180 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
178 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 
176 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.83 
 
 
274 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.87 
 
 
182 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
185 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  29.82 
 
 
177 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  30.69 
 
 
177 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.85 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.52 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.21 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  32.86 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.92 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1936  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  28.17 
 
 
269 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  27.55 
 
 
227 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.55 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  36.36 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.46 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.46 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
177 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  24.72 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.86 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  26.09 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 
183 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.09 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  22.52 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
184 aa  43.9  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
178 aa  43.9  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.86 
 
 
180 aa  43.9  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  28 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  27.08 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.89 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  23.33 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  27.21 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  25.32 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.59 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  31.91 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  29.85 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  36.36 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  29.35 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.89 
 
 
180 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>