More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2002 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 527 aa  1084    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  52.51 
 
 		 517 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  50.48 
 
 		 537 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  51.46 
 
 		 537 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  49.9 
 
 		 537 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  50.7 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  50.3 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  48.37 
 
 		 525 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  49.2 
 
 		 530 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  45.01 
 
 		 530 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  42.64 
 
 		 544 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  42.66 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  39.92 
 
 		 534 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 528 aa  352  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  39.39 
 
 		 525 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 533 aa  337  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 523 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  37.86 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  37.18 
 
 		 527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 523 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 		 530 aa  316  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 527 aa  313  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  37.64 
 
 		 526 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.34 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  28.23 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 508 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.23 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 511 aa  136  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 518 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.46 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.39 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 522 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 505 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 514 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 519 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  24.59 
 
 		 560 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.57 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.32 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 541 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  29.41 
 
 		 495 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.09 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 550 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.88 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.88 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.88 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 526 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 514 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.82 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.85 
 
 		 535 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 516 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 501 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 498 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.64 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  31.52 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.05 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>