129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2329 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  46.58 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  46.58 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  46.58 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  45.06 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  41.94 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  41.94 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  43.59 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  42.95 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  42.95 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  42.95 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  27.65 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  35.14 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  30.84 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30.84 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  33.06 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  29.27 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  26.09 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  28.41 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  29.1 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  23.75 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  24.38 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  24.38 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  24.38 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  24.38 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  24.38 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  27.66 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  23.75 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  23.97 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  31.21 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25.17 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.14 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  25.17 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 363 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  24.66 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  24.32 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  31.94 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  25.55 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0327  electron transport protein SCO1/SenC  31.07 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3697  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  27.92 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  25.34 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  25.34 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  25.34 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  25.34 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.26 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  28.47 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  25.34 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  25.34 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  27.12 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  24.67 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  23.64 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  33.73 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  26.43 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  35.78 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  26.71 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  33.96 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  32.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  26.6 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  34.93 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  26.57 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  38.81 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  26.45 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  26.57 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  26.57 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  30.12 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  32.26 
 
 		 444 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  30.19 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  27.2 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>