203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3697 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3697  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0327  electron transport protein SCO1/SenC  99.49 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0335  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  26.8 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  27.82 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  23.71 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  26.11 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  21.57 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  24.43 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  25.49 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  24.18 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  24.68 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  24.48 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  22.15 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  24.66 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  24.68 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  24.84 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  24.84 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  24.84 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  26.19 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  22.34 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  24.09 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  23.75 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  21.47 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  23.78 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  21.02 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  21.66 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  21.47 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  26.42 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  26.12 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  26.19 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  23.45 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  35.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  25.83 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  21.64 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  24.03 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  21.99 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  24.64 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  27.03 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  32.86 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  23.31 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  22.96 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  25.76 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  23.81 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  21.01 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  19.69 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  22.76 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  25.18 
 
 		 264 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  23.49 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  21.74 
 
 		 706 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  27.13 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  26.13 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  25.56 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  20 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  27.66 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  19.26 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  23.65 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  23.42 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  19.9 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  22.39 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  20 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>