209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0327 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0327  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3697  electron transport protein SCO1/SenC  99.49 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0335  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  26.8 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  27.82 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  23.71 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  26.11 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  21.57 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  23.43 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  25.49 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  25.17 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  24.68 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  24.66 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  24.18 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  24.68 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  22.15 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  24.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  24.84 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  24.84 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  25.48 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  26.19 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  24.09 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  22.34 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  23.75 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  21.47 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  26.87 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  23.78 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  21.02 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  21.47 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  26.42 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  26.19 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  23.45 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  21.66 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  25.83 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  21.64 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  24.03 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  24.64 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  21.99 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  22.46 
 
 		 706 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  22.96 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  23.31 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  35.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  24.49 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  22.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  25.19 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  19.69 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  23.49 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  21.01 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  26.13 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  21.8 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  27.13 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  25.56 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  19.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  19.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  23.42 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  20 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  23.65 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  19.9 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  26.24 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  20.26 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  22.39 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>