More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05402 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  832    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  78.59 
 
 		 411 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  56.34 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  56.45 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  53.27 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 830 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  33.16 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  29.43 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  28.42 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  29.83 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  26.93 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  27.9 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  27.68 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  27.3 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 		 535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  28.78 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  27.32 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  25.56 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.05 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  24.54 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.7 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  25.36 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  26.39 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  26.02 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  24.1 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.04 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  24.7 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  23.8 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  26.43 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  24.28 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  23.06 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  26.14 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.6 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  22.09 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.47 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  24.08 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.3 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  23.87 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.08 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1547  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.21 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.51 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  24.82 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  24.1 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  22.78 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1814  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.34 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.79 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  19.81 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  23.06 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.17 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.55 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.31 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  23.21 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.75 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.53 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.19 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  23.33 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  21.76 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.38 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.11 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  23.65 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  23.51 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.96 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.92 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.14 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2829  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.6 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.417689  normal  0.0183937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.2 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.16 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  22.81 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.7 
 
 		 653 aa  70.5  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.96 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  23.28 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.36 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.97 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.33 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  32.12 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  24.83 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.26 
 
 		 842 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  24.22 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32 
 
 		 843 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0781  ABC lipoprotein exporter, inner membrane subunit, LolE  24.06 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.82 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.27 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  27.54 
 
 		 641 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.37 
 
 		 852 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.68 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>