More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03433 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  88.63 
 
 
343 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  708    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  78.43 
 
 
343 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  62.87 
 
 
346 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  52.1 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  51.1 
 
 
342 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  47.26 
 
 
349 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  51.46 
 
 
342 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.97 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  49.84 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  49.2 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  47.94 
 
 
342 aa  326  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  46.69 
 
 
349 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.94 
 
 
343 aa  325  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  45.53 
 
 
349 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  45.24 
 
 
349 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  45.24 
 
 
349 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
349 aa  322  9.000000000000001e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  50.98 
 
 
341 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
350 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.7 
 
 
358 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.23 
 
 
361 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.65 
 
 
347 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  42.21 
 
 
369 aa  289  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.25 
 
 
357 aa  288  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  43.4 
 
 
369 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.97 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.7 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  43.7 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 
369 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  42.17 
 
 
361 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.32 
 
 
375 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.01 
 
 
369 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
353 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  41.45 
 
 
348 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  43.11 
 
 
357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  42.12 
 
 
368 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  41.55 
 
 
377 aa  272  5.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  42.18 
 
 
354 aa  272  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.9 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  43.79 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.86 
 
 
359 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
371 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  39.83 
 
 
355 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  39.3 
 
 
355 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  40.41 
 
 
354 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
387 aa  261  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.23 
 
 
360 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  40.41 
 
 
355 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  43.4 
 
 
360 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  43.4 
 
 
360 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  48.84 
 
 
389 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  41.31 
 
 
356 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  40.62 
 
 
386 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  39.14 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  40.11 
 
 
354 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
360 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  41.01 
 
 
346 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  39.32 
 
 
361 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 
360 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  39.47 
 
 
342 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  39.47 
 
 
355 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 
257 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  42.31 
 
 
347 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  44.55 
 
 
379 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  42.55 
 
 
368 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 
372 aa  249  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  38.92 
 
 
358 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  38.92 
 
 
358 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  40.35 
 
 
356 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  47.92 
 
 
333 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  39.04 
 
 
390 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  40.29 
 
 
339 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  39.32 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.95 
 
 
259 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
366 aa  245  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
333 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  50.21 
 
 
257 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  50.63 
 
 
257 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  35.26 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  46.64 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  37.9 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  43.59 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  39.94 
 
 
336 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  41.85 
 
 
363 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  41.49 
 
 
363 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 
333 aa  241  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 
333 aa  242  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  39.19 
 
 
353 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  41.08 
 
 
349 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  42.67 
 
 
352 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>