More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02855 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00641  ABC oligopeptide transporter periplasmic component  59.24 
 
 		 609 aa  756    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0869  extracellular solute-binding protein  57.63 
 
 		 626 aa  741    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001852  ABC-type dipeptide transport system component  60.17 
 
 		 608 aa  753    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02855  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1277    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003025  ABC-type dipeptide transport system component  86.11 
 
 		 612 aa  1126    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0942  extracellular solute-binding protein  39.09 
 
 		 621 aa  452  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0985  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  33.06 
 
 		 645 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00011806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1853  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 734 aa  289  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0988  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  30.17 
 
 		 647 aa  249  9e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.356739  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1685  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 668 aa  227  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0732988  normal  0.758738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 609 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 619 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 524 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 597 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 638 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 610 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  20.96 
 
 		 611 aa  97.8  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 626 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 540 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 615 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 628 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  22.38 
 
 		 615 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  20.98 
 
 		 626 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 622 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  21.92 
 
 		 602 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 600 aa  95.1  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 625 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  20.92 
 
 		 607 aa  94.4  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  21.29 
 
 		 602 aa  94  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 559 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  21.95 
 
 		 626 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 600 aa  92  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.2 
 
 		 609 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.25 
 
 		 539 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  21.77 
 
 		 615 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 		 622 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  25.9 
 
 		 602 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 602 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 632 aa  89  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 621 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  25.9 
 
 		 602 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.4 
 
 		 615 aa  88.2  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  19.8 
 
 		 627 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 623 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  21.11 
 
 		 626 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.33 
 
 		 611 aa  87.8  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.63 
 
 		 588 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  22.39 
 
 		 540 aa  87.4  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  19.58 
 
 		 617 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.55 
 
 		 625 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 613 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  20.39 
 
 		 609 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.16 
 
 		 616 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 606 aa  86.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.35 
 
 		 622 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.94 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  20.62 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  20.93 
 
 		 609 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  21.22 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  26.76 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 602 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  21.22 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  19.93 
 
 		 646 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 622 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 607 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  19.93 
 
 		 609 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1104  extracellular solute-binding protein family 5  22.07 
 
 		 622 aa  84  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3144  extracellular solute-binding protein  20.74 
 
 		 637 aa  84  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 607 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  19.14 
 
 		 638 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 604 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  21.95 
 
 		 621 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  21.02 
 
 		 670 aa  83.2  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  21.11 
 
 		 609 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  19.93 
 
 		 590 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 551 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  24.21 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3315  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.54 
 
 		 604 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.644955  normal  0.133502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  22.17 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 661 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2336  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 		 603 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  20.9 
 
 		 538 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.54 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 616 aa  82  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1237  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 622 aa  82  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02107  predicted oligopeptide transporter subunit  25.18 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 624 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1470  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000141163  normal  0.0234366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02066  hypothetical protein  25.18 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0781  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.18 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>