More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00641 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0869  extracellular solute-binding protein  60.66 
 
 		 626 aa  764    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00641  ABC oligopeptide transporter periplasmic component  100 
 
 		 609 aa  1258    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003025  ABC-type dipeptide transport system component  58.22 
 
 		 612 aa  745    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02855  hypothetical protein  59.24 
 
 		 615 aa  756    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001852  ABC-type dipeptide transport system component  92.12 
 
 		 608 aa  1160    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0942  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 621 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0985  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  34.63 
 
 		 645 aa  317  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00011806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1853  extracellular solute-binding protein family 5  32.89 
 
 		 734 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1685  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 668 aa  265  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0732988  normal  0.758738 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0988  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  30.76 
 
 		 647 aa  253  7e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.356739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 633 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 609 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 597 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 610 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 615 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 619 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 607 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  25.04 
 
 		 615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 622 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  22.12 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 611 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 551 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  23 
 
 		 611 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.7 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.64 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  22.3 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.17 
 
 		 538 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.65 
 
 		 611 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 613 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 524 aa  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 600 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 606 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 616 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 621 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.81 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 		 540 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.55 
 
 		 616 aa  101  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 622 aa  101  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.22 
 
 		 615 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 638 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 510 aa  100  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.21 
 
 		 618 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.2 
 
 		 628 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 640 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.17 
 
 		 622 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  21.18 
 
 		 602 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 659 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 		 609 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  23.83 
 
 		 631 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.98 
 
 		 610 aa  96.3  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  21.42 
 
 		 610 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  22 
 
 		 613 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 538 aa  94.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 604 aa  94.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 670 aa  94  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 554 aa  94  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 622 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  22.77 
 
 		 615 aa  94  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 539 aa  94  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 508 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  21.26 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  20.39 
 
 		 609 aa  92.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 646 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  21.88 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 604 aa  91.3  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 622 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 557 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 619 aa  91.3  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 540 aa  90.9  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 590 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2336  extracellular solute-binding protein family 5  21.14 
 
 		 603 aa  90.5  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 559 aa  90.9  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 		 631 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 616 aa  90.5  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.76 
 
 		 531 aa  90.1  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  20.56 
 
 		 617 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 623 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 565 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 618 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3144  extracellular solute-binding protein  20.85 
 
 		 637 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 626 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  20.23 
 
 		 602 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 620 aa  87.8  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 544 aa  87.4  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 621 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  21.78 
 
 		 602 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 602 aa  87  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 		 626 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 631 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.24 
 
 		 575 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2973  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 615 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>