136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02111 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  81.85 
 
 		 293 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  71.13 
 
 		 291 aa  384  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  41.44 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  38.33 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  37.06 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  35.66 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  36.24 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  37.16 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  33.79 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  31.47 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  28.93 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  31.4 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  27.34 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  27.49 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  30.41 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  27.65 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  28.33 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  31 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  29.73 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  30.5 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  30.5 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  31.09 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  25.18 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.01 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  31.75 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  24.03 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  24.03 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.14 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.67 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  21.68 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25.36 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  26.27 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  23.72 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  26.51 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.38 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.38 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.38 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  23.88 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  21.17 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.81 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  26.17 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  23 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.1 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  23.23 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.37 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  26.84 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  23.42 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.17 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.7 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  23.76 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  22.71 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  23.45 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  24.03 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  24.03 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  21.98 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  25 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.64 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  24.33 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.05 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  23.27 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.41 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>