More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001334 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  100 
 
 		 240 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  94.58 
 
 		 276 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  61.97 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 259 aa  291  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  56.49 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  56.49 
 
 		 272 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  56.07 
 
 		 258 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  52.72 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  43.29 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  39.83 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.24 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 273 aa  197  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  38.91 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  38.91 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 262 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 272 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.65 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  33.19 
 
 		 272 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 272 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 268 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  30.8 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 295 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  31.7 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.98 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  31.98 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 272 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  31.56 
 
 		 264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  31.08 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 294 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001035  transcriptional regulator AraC/XylS family  29.6 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 		 305 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>