162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000467 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  100 
 
 		 1057 aa  2192    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  29.92 
 
 		 1079 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.01 
 
 		 1096 aa  287  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  24.31 
 
 		 1192 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24 
 
 		 1131 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  22.16 
 
 		 1188 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3719  hypothetical protein  62.82 
 
 		 108 aa  109  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 		 1403 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  24.4 
 
 		 954 aa  87.4  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.98 
 
 		 1034 aa  84.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  21.72 
 
 		 1320 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  20.36 
 
 		 1422 aa  79.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.86 
 
 		 1117 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.01 
 
 		 1081 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  22.39 
 
 		 1123 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 973 aa  76.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3153  hypothetical protein  22.54 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  21.98 
 
 		 1123 aa  75.1  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.82 
 
 		 1141 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  23.05 
 
 		 1123 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  23.28 
 
 		 1055 aa  73.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 		 1402 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  22.13 
 
 		 1046 aa  73.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  22.78 
 
 		 1022 aa  72.8  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  21.96 
 
 		 1029 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  22.53 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.33 
 
 		 1080 aa  71.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  21.67 
 
 		 1054 aa  71.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  23.27 
 
 		 967 aa  70.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  21.16 
 
 		 1198 aa  70.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  20.5 
 
 		 1147 aa  69.3  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.65 
 
 		 1055 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.04 
 
 		 1429 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 1321 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  19.42 
 
 		 1468 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  24.18 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  21.1 
 
 		 1148 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.87 
 
 		 1089 aa  67.4  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  22.89 
 
 		 1006 aa  66.6  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  23.55 
 
 		 955 aa  67  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  20.46 
 
 		 983 aa  66.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  23.84 
 
 		 1133 aa  66.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  22.07 
 
 		 1105 aa  65.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  20.31 
 
 		 1094 aa  64.7  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  23.59 
 
 		 916 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  22.92 
 
 		 1130 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  23.78 
 
 		 1271 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.55 
 
 		 1291 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  22.09 
 
 		 872 aa  64.3  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  21.54 
 
 		 1139 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 1015 aa  63.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 		 1311 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.23 
 
 		 1360 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  21.15 
 
 		 1383 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.43 
 
 		 1403 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  21.01 
 
 		 967 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  21.68 
 
 		 1037 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.43 
 
 		 1175 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  22.95 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  22.28 
 
 		 999 aa  61.6  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  24.93 
 
 		 1013 aa  61.6  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  21.05 
 
 		 844 aa  61.6  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  21.77 
 
 		 1050 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.77 
 
 		 1050 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.73 
 
 		 1422 aa  61.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  20.83 
 
 		 1134 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  22.35 
 
 		 1160 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  19.96 
 
 		 1142 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  24.14 
 
 		 1114 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  21.95 
 
 		 1712 aa  59.7  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  23 
 
 		 955 aa  59.3  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.26 
 
 		 1149 aa  58.9  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  20.89 
 
 		 1029 aa  58.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  22.95 
 
 		 966 aa  58.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  23.16 
 
 		 922 aa  58.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 981 aa  58.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.44 
 
 		 1053 aa  58.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 975 aa  58.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  20.79 
 
 		 1346 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.92 
 
 		 1295 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 1398 aa  57.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  24.88 
 
 		 905 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  21.38 
 
 		 1685 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  23.49 
 
 		 1063 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  25.34 
 
 		 1132 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  21.16 
 
 		 1198 aa  57.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1142 aa  57  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  21.4 
 
 		 1153 aa  56.6  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  22.32 
 
 		 1138 aa  56.2  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  20.21 
 
 		 1666 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  21 
 
 		 947 aa  55.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.76 
 
 		 852 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  22.45 
 
 		 928 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  20.86 
 
 		 993 aa  55.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  22.4 
 
 		 892 aa  55.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  20.83 
 
 		 965 aa  55.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  19.83 
 
 		 1400 aa  55.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  22.81 
 
 		 982 aa  55.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>