More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2824 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  100 
 
 		 407 aa  830    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  72.3 
 
 		 407 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  70.76 
 
 		 407 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  69.29 
 
 		 408 aa  598  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  50.61 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  50.37 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  50.37 
 
 		 406 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  50.61 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  51.35 
 
 		 406 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  49.63 
 
 		 406 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  51.96 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  49.63 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  50.86 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  50.86 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  50.86 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  49.63 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  50.86 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  50.61 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  50.86 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  50.12 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  50.61 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  48.79 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  49.76 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  47.15 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  45.34 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  43.46 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  44.75 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  43.42 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  45.02 
 
 		 406 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  44.12 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  42.14 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  41.03 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  33.09 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  33 
 
 		 405 aa  252  7e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  34.33 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.6 
 
 		 405 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  33.25 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33.25 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  34.47 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  31.7 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  34.47 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  32.36 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  31.28 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.66 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  32.59 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 407 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  34.51 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 407 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 408 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  32.76 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  31.02 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  32.67 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  30.54 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 406 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 401 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  32.28 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 405 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  31.34 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  31.09 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.6 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  31.44 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.73 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.25 
 
 		 401 aa  226  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  28.97 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  31.44 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  31.44 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  32.43 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  31.23 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  30 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>