88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0298 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004329  chitinase  78.77 
 
 		 567 aa  900    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  80.04 
 
 		 566 aa  936    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  100 
 
 		 574 aa  1186    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  43.82 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  43.82 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  46.67 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  43.82 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  43.82 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  46.86 
 
 		 565 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  30 
 
 		 709 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  35.03 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  67.35 
 
 		 1051 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  29.66 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  28.57 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  28.19 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  38.66 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  27.57 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  28.16 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  40.5 
 
 		 904 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  27.98 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  27.39 
 
 		 296 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  27.47 
 
 		 295 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  58.97 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  27.8 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  63.04 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  63.04 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  26.56 
 
 		 384 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  26.84 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  26.84 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  40.62 
 
 		 1242 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  50 
 
 		 868 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  26.84 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  57.78 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  50 
 
 		 868 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  62.22 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 868 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  62.5 
 
 		 772 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  62.22 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  62.22 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 867 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  62.22 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  62.22 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  40.62 
 
 		 540 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  60.87 
 
 		 504 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  57.78 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.82 
 
 		 669 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 868 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 868 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  57.78 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.51 
 
 		 816 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  46.03 
 
 		 869 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  51.22 
 
 		 426 aa  54.3  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  42.62 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  50 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  36.49 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  57.78 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  46.3 
 
 		 868 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  53.49 
 
 		 401 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  33.33 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  46 
 
 		 848 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  47.83 
 
 		 451 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  47.5 
 
 		 855 aa  50.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  55.26 
 
 		 846 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  47.62 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  55 
 
 		 855 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  36.78 
 
 		 1577 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  47.62 
 
 		 639 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  48.84 
 
 		 1057 aa  48.5  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  32.47 
 
 		 1053 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  47.37 
 
 		 1331 aa  47.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  47.73 
 
 		 863 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  39.77 
 
 		 183 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  48.72 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 		 699 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  39.29 
 
 		 985 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  57.89 
 
 		 763 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  43.59 
 
 		 699 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  40.82 
 
 		 848 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  51.43 
 
 		 626 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  51.43 
 
 		 1362 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  45.24 
 
 		 729 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  40.43 
 
 		 392 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  45.24 
 
 		 729 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  55.26 
 
 		 591 aa  43.9  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 445 aa  43.5  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  27 
 
 		 634 aa  43.5  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>