More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0179 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03864  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.02 
 
 		 1407 aa  777    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4007  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  40.02 
 
 		 1407 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0588  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.17 
 
 		 1396 aa  772    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0604  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  41.1 
 
 		 1295 aa  820    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0448  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.27 
 
 		 1399 aa  809    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402854  unclonable  0.0000011362 
 
 
-
 
NC_002950  PG0395  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.7 
 
 		 1433 aa  798    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2420  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.54 
 
 		 1424 aa  650    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00279093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0184  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  46.8 
 
 		 1207 aa  938    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0118718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  38.61 
 
 		 1400 aa  760    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3033  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.43 
 
 		 1409 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188142  hitchhiker  0.00329895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.36 
 
 		 1203 aa  931    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00223812  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3177  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.22 
 
 		 1412 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0529  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  40.7 
 
 		 1517 aa  781    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0161  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  44.82 
 
 		 1216 aa  911    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1242  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.48 
 
 		 1400 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0620  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  39.65 
 
 		 1399 aa  805    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.354282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.36 
 
 		 1203 aa  940    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.36 
 
 		 1203 aa  931    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl597  DNA-directed RNA polymerase beta subunit  50.98 
 
 		 1254 aa  1259    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.36 
 
 		 1203 aa  931    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2640  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.22 
 
 		 1412 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0388  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.85 
 
 		 1401 aa  803    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0363  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.85 
 
 		 1401 aa  804    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4554  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.65 
 
 		 1399 aa  805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397479 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1886  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.91 
 
 		 1406 aa  762    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.315745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.13 
 
 		 1403 aa  752    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267546  hitchhiker  0.00189389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2653  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.69 
 
 		 1291 aa  929    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229065  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3188  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.33 
 
 		 1415 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0399  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.56 
 
 		 1398 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.589703  normal  0.0776208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1351  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.16 
 
 		 1399 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.221368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3785  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.22 
 
 		 1412 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2330  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.5 
 
 		 1403 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000376079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5085  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.74 
 
 		 1399 aa  806    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00230086  normal  0.866295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1712  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.31 
 
 		 1415 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0695  RNA polymerase, beta prime subunit  42.56 
 
 		 1396 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000131874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3440  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.58 
 
 		 1414 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19828  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1961  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.88 
 
 		 1498 aa  799    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.549575  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0358  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.5 
 
 		 1502 aa  796    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0620  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  42.03 
 
 		 1392 aa  810    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.7637000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0289  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.08 
 
 		 1408 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000201644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.36 
 
 		 1194 aa  941    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00902184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0354  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  41.75 
 
 		 1503 aa  771    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0760  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.92 
 
 		 1408 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0071  DNA-directed RNA polymerase beta' subunit  50 
 
 		 1255 aa  1234    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00020  DNA-directed RNA polymerase beta' subunit  43.09 
 
 		 1435 aa  830    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2467  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  44.79 
 
 		 1164 aa  880    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3075  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.22 
 
 		 1412 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1593  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  41.52 
 
 		 1394 aa  771    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0574  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.11 
 
 		 1295 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2286  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.38 
 
 		 1400 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.604145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0023  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  43.52 
 
 		 1427 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0569  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.28 
 
 		 1404 aa  651    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.870967 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0572  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.74 
 
 		 1403 aa  641    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0925  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.02 
 
 		 1410 aa  764    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.15771  hitchhiker  0.00023271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3457  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.92 
 
 		 1401 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0273  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.55 
 
 		 1409 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0012908  unclonable  0.000000465088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0713  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  38.49 
 
 		 1404 aa  789    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0307  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.05 
 
 		 1412 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.06 
 
 		 1400 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0226545  normal  0.686552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.4 
 
 		 1405 aa  771    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443299  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1532  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.56 
 
 		 1399 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2176  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.09 
 
 		 1399 aa  766    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.120941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3333  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.41 
 
 		 1413 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0503  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.66 
 
 		 1408 aa  787    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.630998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4675  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  41.59 
 
 		 1445 aa  835    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0479992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0635  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  42.21 
 
 		 1537 aa  754    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0235  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.89 
 
 		 1410 aa  653    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0585906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1485  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  43.74 
 
 		 1427 aa  662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614048  normal  0.379046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2766  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.58 
 
 		 1413 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.99 
 
 		 1315 aa  909    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2161  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.34 
 
 		 1295 aa  790    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0599  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.51 
 
 		 1395 aa  788    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.275775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1818  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  43.29 
 
 		 1399 aa  804    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3168  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.83 
 
 		 1438 aa  828    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2721  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  43.82 
 
 		 1178 aa  993    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2407  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  43.82 
 
 		 1178 aa  993    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1564  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.3 
 
 		 1420 aa  781    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0452  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.18 
 
 		 1426 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0142  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.7 
 
 		 1408 aa  758    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0021761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2340  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  43.02 
 
 		 1181 aa  853    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0020825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1801  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.35 
 
 		 1405 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.669394  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0260  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.58 
 
 		 1413 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08780  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.77 
 
 		 1399 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0182127 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1980  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  42.75 
 
 		 1207 aa  1044    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1374  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  44.43 
 
 		 1233 aa  1058    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0285  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  43.84 
 
 		 1223 aa  1054    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1824  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  44.47 
 
 		 1220 aa  876    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1844  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.39 
 
 		 1212 aa  905    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2983  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.25 
 
 		 1299 aa  927    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0341  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.58 
 
 		 1413 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1550  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  42.25 
 
 		 1351 aa  795    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0841  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  41.8 
 
 		 1412 aa  796    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0300  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.47 
 
 		 1304 aa  957    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801112 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1314  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  42.37 
 
 		 1508 aa  805    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.192616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0674  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  42.65 
 
 		 1409 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0573556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0234  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  41.55 
 
 		 1492 aa  796    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0749  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.85 
 
 		 1402 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0676703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0712  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  40.59 
 
 		 1290 aa  945    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.6 
 
 		 1404 aa  763    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106515  hitchhiker  0.000290972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0988  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  39.99 
 
 		 1315 aa  909    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.077101  normal  0.709558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>