167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2570 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  39.17 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  35.45 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.13 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  30.17 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  29.44 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  31.15 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  30.85 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  32.03 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.78 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.93 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  26.98 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.44 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  28.42 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  28.42 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  28.42 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  28.49 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  28.49 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  30.21 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  38.74 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.93 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.37 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  31.82 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.82 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.45 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.29 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  28.02 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.75 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  26.52 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  25.56 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.52 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  29.5 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  28.57 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  28.57 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  26.89 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  25.7 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  25.56 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.65 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  25.34 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  32.33 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.55 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.79 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  25.68 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  24.88 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  26.82 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  23.98 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  29.1 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  28.42 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  27.17 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.41 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  24.19 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  31.69 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.12 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  25.57 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  25.98 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  23.56 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  26.49 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  28.34 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  33.99 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  27.87 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  28.65 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  30.39 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  26.23 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  26.94 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  27.66 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  27.13 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  28.26 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.38 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  27.81 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.1 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  29.41 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  34.21 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  34.21 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  34.21 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.88 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  26.32 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.36 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.1 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  29.7 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  27.71 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  27.42 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.99 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  25.26 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  28.8 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.19 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  25.34 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  30.07 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.21 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  29.23 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>