109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1503 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  100 
 
 
330 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  64.33 
 
 
330 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  63.3 
 
 
297 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  44.91 
 
 
326 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  46.25 
 
 
339 aa  279  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  47.15 
 
 
326 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
326 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  41.74 
 
 
325 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  43.9 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  39.82 
 
 
338 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  39.76 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  43.12 
 
 
336 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  38.61 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  38.33 
 
 
358 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  35.31 
 
 
317 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  39.12 
 
 
340 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  30.27 
 
 
326 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  35.35 
 
 
339 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  31.86 
 
 
331 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  32.24 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  30 
 
 
336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  30 
 
 
336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 
337 aa  122  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  30.71 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.57 
 
 
339 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  30.42 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  28.66 
 
 
335 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.41 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.67 
 
 
629 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.74 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.51 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.21 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  31.56 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.87 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.85 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.24 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.8 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.62 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.13 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.67 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.37 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.17 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.33 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.82 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.61 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.66 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
366 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  27.33 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.2 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
334 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25.51 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  31.84 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.1 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
403 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
388 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.75 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.26 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
312 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.31 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
378 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  22.48 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  23.59 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.57 
 
 
402 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
441 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  24.7 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
409 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  23.99 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  22.91 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  23.79 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>