More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1396 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  100 
 
 		 355 aa  723    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  66.95 
 
 		 352 aa  495  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  62.46 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  62.18 
 
 		 360 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  49.26 
 
 		 361 aa  318  6e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.71 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.91 
 
 		 360 aa  308  9e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  48.69 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  46.35 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49.7 
 
 		 351 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  46.37 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  47.66 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  47.65 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  46.11 
 
 		 360 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  52.2 
 
 		 351 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  48.39 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  44.85 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  46.47 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  45.96 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  45.96 
 
 		 372 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  48.51 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  44.71 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  44.71 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  48.51 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  45.22 
 
 		 374 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  48.77 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  49.84 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  48.15 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  44.71 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  46.67 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  47.43 
 
 		 366 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  44.44 
 
 		 378 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  47.76 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  47.43 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  45.48 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  46.76 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  43.54 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  46.76 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  46.89 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  46.07 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  46.89 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  47.32 
 
 		 365 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.51 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0043  twitching motility protein  42.9 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  43.47 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  46.89 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  45.95 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  44.73 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  46.91 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  45.37 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  49.84 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  44.61 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  44.13 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  43.73 
 
 		 348 aa  282  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  44.8 
 
 		 347 aa  282  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  44.51 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  45.95 
 
 		 347 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  45.03 
 
 		 347 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  45.81 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  44.87 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  45.4 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  42.17 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  44.87 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  48.45 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.03 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  46.02 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  44.44 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  44.9 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  46.5 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  42.53 
 
 		 371 aa  279  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  41.91 
 
 		 371 aa  280  4e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  45.07 
 
 		 363 aa  279  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  46.11 
 
 		 367 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  44.87 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  44.48 
 
 		 372 aa  279  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  44.22 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  45 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  46.89 
 
 		 347 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  46.13 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.63 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  44.93 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  43.99 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  44.03 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  42.98 
 
 		 566 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  45.48 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  44.07 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  43.15 
 
 		 351 aa  275  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  45.97 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  44.28 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  45.11 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  43.99 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  45.13 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  44.57 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1643  twitching motility protein PilT  45.72 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  43.99 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  46.96 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  43.93 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  43.99 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1141  Tfp pilus assembly protein pilus retraction ATPase  41.91 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000163324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  43.93 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>