More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2804 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2804  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 388 aa  741    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3957  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.6 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  37.02 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 404 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  30.93 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  28.83 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  38.97 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  32.35 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  28.76 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  30.85 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  31.1 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  30.43 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  31.4 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 538 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  30.51 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  31.31 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  29.36 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  29.36 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  36.17 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  29.06 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2147  secretion protein HlyD  31.19 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 		 531 aa  94  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  30.37 
 
 		 484 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 489 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 491 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 		 454 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  29.06 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  26.01 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.53 
 
 		 459 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  29.04 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 503 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 457 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  31.14 
 
 		 491 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  30.17 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  30.46 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  30.17 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  29.89 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  30.17 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  30.17 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  28.86 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  30.17 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.95 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  26.45 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.07 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  28.38 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2030  biotin/lipoyl attachment  40.66 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.359501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1958  putative RND efflux system protein, MFP subunit  26.77 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  25 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.12 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.01 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  20.94 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  26.47 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.61 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.94 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  27.27 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  23.83 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1956  hypothetical protein  28.27 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0111518  normal  0.309858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.14 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  26.54 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  22.7 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  27.33 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  27.96 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 		 607 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  26.96 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  22.61 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  24.56 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.95 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>