More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2796 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  100 
 
 		 397 aa  793    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.4 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  36.95 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.47 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  33.33 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  33.67 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  36.95 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  37.73 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  36.08 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  36.57 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  38.99 
 
 		 350 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  37.38 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  32.88 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  28.36 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  29.89 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  30.88 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  29.33 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  26.62 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.59 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.44 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 		 692 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  30.22 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  28.26 
 
 		 713 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.2 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  29.83 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.82 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  27.67 
 
 		 688 aa  73.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  30.99 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  31.44 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.88 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  27.37 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.94 
 
 		 847 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  29.05 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  26.91 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.8 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30 
 
 		 1051 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.22 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1248 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.55 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  27.59 
 
 		 612 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  29.2 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  25 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 		 260 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  26.15 
 
 		 885 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.19 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  27.6 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  28.28 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.8 
 
 		 1332 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  25.98 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  27.6 
 
 		 786 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.83 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.77 
 
 		 692 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.95 
 
 		 616 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.51 
 
 		 706 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  29.38 
 
 		 700 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  30.58 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  32.63 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.93 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  27.68 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.88 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  27.6 
 
 		 785 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  27.37 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.75 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  28.34 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  28.02 
 
 		 562 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 		 697 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  30.35 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.12 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 1361 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.06 
 
 		 817 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  25.94 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  27.24 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 		 757 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 		 693 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  28.51 
 
 		 744 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  28.9 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  30.4 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.36 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  25.17 
 
 		 1083 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  30.4 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  27.95 
 
 		 716 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  30.4 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.32 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  26.85 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  25.32 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  26.98 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  26.04 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.45 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.88 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>