253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0577 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  100 
 
 		 216 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  61.68 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  63.59 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  56.34 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  58.37 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  49.27 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  48.34 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.28 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  51.21 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  49.51 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  48.58 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.51 
 
 		 222 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.23 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.23 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.29 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  46.83 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  54.69 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  29.01 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  40.17 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  30.34 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.59 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.16 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  37.36 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.66 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.77 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  28.67 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  30.51 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.83 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.51 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  29.66 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  32.03 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  32.03 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  28.43 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.04 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  39.24 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  33.74 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.95 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.24 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.31 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2294  HAD superfamily hydrolase  21.76 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  32.69 
 
 		 128 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.39 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.12 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  35.64 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  30.82 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  30.13 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  30.82 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  27.75 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  30.3 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  37.01 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  29.06 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.2 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  29.82 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  25.37 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  27.46 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.11 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  42.31 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  29.91 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  44.68 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  33.58 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  34.06 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  33.58 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  24.32 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.47 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  31.68 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  26.94 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  44.23 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  34.52 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  34.52 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  26.94 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  26.94 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>