More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4049 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
430 aa  807    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  66.18 
 
 
455 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  62.53 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  68.95 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  65.82 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  61.14 
 
 
454 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  60.13 
 
 
449 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  60.13 
 
 
449 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  60.13 
 
 
449 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  61.22 
 
 
441 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  59.96 
 
 
457 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  59.46 
 
 
430 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  51.16 
 
 
436 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  55.32 
 
 
432 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  59.74 
 
 
430 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  52.32 
 
 
473 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  56.38 
 
 
430 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  55.68 
 
 
431 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  52.97 
 
 
437 aa  355  8.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  56.59 
 
 
412 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  59.61 
 
 
444 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  57.74 
 
 
430 aa  346  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  48.84 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  49.07 
 
 
432 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  30.49 
 
 
436 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  27.87 
 
 
436 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.97 
 
 
428 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 
469 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.62 
 
 
440 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  30.48 
 
 
440 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  30.12 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.85 
 
 
428 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 
444 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 
444 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.26 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.4 
 
 
444 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 
436 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  24.77 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 
446 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.55 
 
 
458 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  32.22 
 
 
443 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.99 
 
 
444 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.97 
 
 
444 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  30 
 
 
429 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  36.86 
 
 
443 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  29.82 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  30.07 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.31 
 
 
443 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.09 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 
444 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  35.53 
 
 
298 aa  93.6  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.34 
 
 
295 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.37 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.84 
 
 
302 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 
296 aa  86.3  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  33.59 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.05 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.43 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.72 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  35.94 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.88 
 
 
296 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.36 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.6 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.46 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.59 
 
 
314 aa  77  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  32.98 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  32.22 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  30.85 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.08 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  31.19 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.35 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.11 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  34.29 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  32.61 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.59 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.62 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  31.79 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  32.99 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.26 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  35.92 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.26 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.54 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  23.85 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  36.76 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.94 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  28.47 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.86 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.02 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  23.7 
 
 
286 aa  67  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.06 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  45.45 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.53 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  36.63 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  46.67 
 
 
311 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  36.63 
 
 
314 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  50 
 
 
341 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>