107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0436 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
218 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
199 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
199 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
199 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
206 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  36.7 
 
 
196 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  32.8 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
194 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
194 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
194 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  38.42 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
194 aa  72  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  26.7 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  38.32 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
219 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
209 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
213 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.81 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 
197 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  31.14 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 
211 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
403 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  27.66 
 
 
165 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 
423 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
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NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
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NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
195 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
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