More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2061 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 547 aa  1048    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  58.81 
 
 		 581 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  52.13 
 
 		 584 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  44.2 
 
 		 714 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  46.56 
 
 		 606 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  44.31 
 
 		 670 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  43.55 
 
 		 620 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  42.75 
 
 		 635 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  41.54 
 
 		 684 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  40.29 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  40.83 
 
 		 585 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  40.67 
 
 		 564 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  41.79 
 
 		 620 aa  343  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  38.89 
 
 		 640 aa  336  7e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  39.75 
 
 		 607 aa  329  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  42.44 
 
 		 566 aa  326  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  38.76 
 
 		 661 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  41.29 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  45.53 
 
 		 674 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  48.47 
 
 		 605 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  38.39 
 
 		 538 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  46.5 
 
 		 603 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  35.81 
 
 		 632 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  37.75 
 
 		 573 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  46.93 
 
 		 617 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  40.86 
 
 		 656 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  41.49 
 
 		 653 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  42.11 
 
 		 666 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  42.07 
 
 		 649 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  34.72 
 
 		 496 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.53 
 
 		 989 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  27.51 
 
 		 885 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  31.9 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  28.66 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  28.66 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  29.08 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  33.86 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  34.25 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  31.36 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  32.76 
 
 		 534 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  24.8 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  33.44 
 
 		 533 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  33.02 
 
 		 403 aa  143  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  25.24 
 
 		 489 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 		 977 aa  143  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.7 
 
 		 848 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  32.75 
 
 		 594 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  32.75 
 
 		 594 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.47 
 
 		 530 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  27.52 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.81 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  25 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  31.43 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.38 
 
 		 853 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.43 
 
 		 531 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.13 
 
 		 839 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.35 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  27.76 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  33.88 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.61 
 
 		 849 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.17 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  33.22 
 
 		 464 aa  135  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  34.69 
 
 		 532 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  25.29 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  30.93 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.6 
 
 		 532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  28.99 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.43 
 
 		 856 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  35.9 
 
 		 900 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 		 532 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 410 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  32.74 
 
 		 531 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  27.79 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  31.83 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  31.83 
 
 		 554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  27.25 
 
 		 1029 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  32.22 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  29.91 
 
 		 761 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.69 
 
 		 856 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  31.95 
 
 		 470 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  32.03 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  32.01 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.09 
 
 		 991 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  32.01 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  35.61 
 
 		 855 aa  126  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  28.43 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  27.73 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.02 
 
 		 846 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  26.67 
 
 		 515 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  33 
 
 		 556 aa  125  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  27.94 
 
 		 613 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  28.89 
 
 		 613 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  27.29 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  29.91 
 
 		 594 aa  123  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  32.61 
 
 		 533 aa  123  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>